精怎样才能留住员工

我是一家软件开发公司的行政助理，公司的大多数员工为程序员。因IT行业普遍存在人员流动频繁的现象。公司领导决定模仿东软公司：员工入职后将个人档案调过来，或将学历证书暂存公司。目的不是为了扣押员工证书，只是相互有个制约。离职时按正常手续办好交接，就把证书退还个人。公司员工大多数为在京打工的年轻人，而且是外地的，不太确定以后的归宿，所以不愿调档案，而且把证书存公司又不太放心。虽然我的证书已经存公司档案，但我个人并不支持这种做法。经过和公司领导的沟通协调，终于同意在试用期满再将学历证书存公司档案，近几个月的新员工入职都是这样办理的，3个月的试用时间，大家相互之间有个认知的过程。因工作的特殊性和保密性，这样的做法大家都还可以接受。但上个月末有几个员工在领完工资后就一声不响的离开公司了，对正在进行的项目工作造成了一定的影响。公司领导再度提起要在办理入职时就将证书存公司档案。站在公司的角度上，我个人认为这是可行的。但站在员工的角度上，这样有点儿不太好，新员工入职对公司各方面都不太了解，不会同意这种做法的。而且这样的话会让我们失去很多得到人才的机会。二者各有得失，但现在的关键问题还是要解决的，如果仍保持试用期后将学历证书存公司档案，那3个月该怎么办？人员流动太频繁，对公司的正常运作不太好的。各位做HR的前辈，帮帮忙，想想办法，看这个问题该怎么解决呀？有没有什么比较合理的解决方法？让双方都可以接受的。